Mineraler i ledningsvandet kan forstyrre rengøringsprocessen og danne aflejringer på instrumenter og i produktet. Mieles termodesinfektorer er fra fabrikken udstyret med et afkalkningsanlæg, som i vid udstrækning fjerner hårdhedsdannende ioner fra postevandet. I tilfælde af meget hårdt ledningsvand og i praksisser med en stor mængde instrumenter kan det betale sig at foretage en yderligere, fuldstændig demineralisering af vandet.